Mirando la pagina de descarga del ADTPro encontre este el Apple Commander, un programita hecho en java que permite manejar los discos de la II desde Windows, Linux y OSX.

Creo que puede estar bueno sobre todo para armar discos para los emuladores de Apple II

Link del proyecto:
http://applecommander.sourceforge.net/

Link de descarga:
http://sourceforge.net/projects/applecommander/files/AppleCommander%20-%20Interim/